Свою діяльність Сторожинецька філія розпочала у червні 1997 року як Сторожинецьке відділення Українського фінансово-економічного інституту, створене наказом від 19.06 1997 року №510.
Наказом Державної податкової адміністрації України від 22 березня 2000 року №123 було реорганізоване і на його базі створений Сторожинецький факультет заочної форми навчання Академії державної податкової служби України. Наказом Національного університету державної податкової адміністрації України від 31 травня 2007 року №323 створено Сторожинецьку філію як структурний підрозділ Національного університету державної податкової служби України без створення юридичної особи.
Філія здійснює освітню діяльність з надання вищої освіти за напрямами та спеціальностями освітньо-кваліфікаційних рівнів «бакалавр» та «спеціаліст».
Відомче підпорядкування:
Національний університет державної податкової служби України
Перелік напрямів:
Економіка і підприємництво
- бакалавр (ІІІ р.а.);
- спеціаліст (ІІІ р.а.).
Перелік спеціальностей:
- облік та аудит;
- оподаткування;
- фінанси.
